Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARK3P27448 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARK3P27448 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARK3P27448 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARK3P27448 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARK3P27448 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARK3P27448 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARK3P27448 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARK3P27448 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARK3P27448 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARK3P27448 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARK3P27448 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARK3P27448 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MARK3P27448 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARK3P27448 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARK3P27448 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARK3P27448 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARK3P27448 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARK3P27448 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARK3P27448 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARK3P27448 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MARK3P27448 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MARK3P27448 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MARK3P27448 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MARK3P27448 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MARK3P27448 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MARK3P27448 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MARK3P27448 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MARK3P27448 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MARK3P27448 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MARK3P27448 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MARK3P27448 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MARK3P27448 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MARK3P27448 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MARK3P27448 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARK3P27448 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARK3P27448 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARK3P27448 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARK3P27448 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARK3P27448 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARK3P27448 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARK3P27448 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARK3P27448 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARK3P27448 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MARK3P27448 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARK3P27448 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARK3P27448 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARK3P27448 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARK3P27448 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARK3P27448 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARK3P27448 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MARK3P27448 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARK3P27448 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARK3P27448 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARK3P27448 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARK3P27448 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARK3P27448 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARK3P27448 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARK3P27448 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARK3P27448 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MARK3P27448 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARK3P27448 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARK3P27448 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARK3P27448 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARK3P27448 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARK3P27448 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARK3P27448 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARK3P27448 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARK3P27448 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MARK3P27448 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARK3P27448 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARK3P27448 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARK3P27448 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARK3P27448 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARK3P27448 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARK3P27448 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARK3P27448 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARK3P27448 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARK3P27448 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARK3P27448 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARK3P27448 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARK3P27448 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARK3P27448 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARK3P27448 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARK3P27448 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARK3P27448 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MARK3P27448 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARK3P27448 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARK3P27448 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARK3P27448 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MARK3P27448 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARK3P27448 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARK3P27448 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARK3P27448 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARK3P27448 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARK3P27448 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARK3P27448 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARK3P27448 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARK3P27448 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARK3P27448 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms