Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMA4P25789 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMA4P25789 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.6 ms