Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA1P25786 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms