Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGFR4P22455 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms