Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCF2P19878 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCF2P19878 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCF2P19878 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCF2P19878 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCF2P19878 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCF2P19878 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCF2P19878 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCF2P19878 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NCF2P19878 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCF2P19878 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCF2P19878 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCF2P19878 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCF2P19878 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCF2P19878 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCF2P19878 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCF2P19878 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCF2P19878 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NCF2P19878 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCF2P19878 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCF2P19878 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCF2P19878 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCF2P19878 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCF2P19878 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCF2P19878 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCF2P19878 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCF2P19878 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCF2P19878 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCF2P19878 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCF2P19878 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCF2P19878 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCF2P19878 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCF2P19878 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF2P19878 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF2P19878 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF2P19878 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF2P19878 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF2P19878 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF2P19878 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCF2P19878 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCF2P19878 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCF2P19878 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCF2P19878 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCF2P19878 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF2P19878 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCF2P19878 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCF2P19878 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCF2P19878 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCF2P19878 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCF2P19878 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NCF2P19878 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NCF2P19878 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCF2P19878 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCF2P19878 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NCF2P19878 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCF2P19878 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCF2P19878 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF2P19878 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF2P19878 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF2P19878 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF2P19878 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF2P19878 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF2P19878 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF2P19878 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF2P19878 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF2P19878 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF2P19878 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCF2P19878 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCF2P19878 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCF2P19878 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCF2P19878 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCF2P19878 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCF2P19878 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NCF2P19878 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCF2P19878 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCF2P19878 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCF2P19878 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCF2P19878 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NCF2P19878 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCF2P19878 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCF2P19878 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCF2P19878 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCF2P19878 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCF2P19878 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCF2P19878 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCF2P19878 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms