Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSCAN20P17040 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSCAN20P17040 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSCAN20P17040 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSCAN20P17040 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSCAN20P17040 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSCAN20P17040 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSCAN20P17040 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSCAN20P17040 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
ZSCAN20P17040 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZSCAN20P17040 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms