Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF3P15923 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCF3P15923 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF3P15923 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF3P15923 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF3P15923 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF3P15923 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCF3P15923 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF3P15923 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF3P15923 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF3P15923 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF3P15923 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF3P15923 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF3P15923 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF3P15923 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCF3P15923 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF3P15923 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF3P15923 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF3P15923 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCF3P15923 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF3P15923 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF3P15923 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF3P15923 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF3P15923 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF3P15923 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF3P15923 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF3P15923 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF3P15923 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF3P15923 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF3P15923 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF3P15923 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF3P15923 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF3P15923 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF3P15923 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF3P15923 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF3P15923 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF3P15923 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF3P15923 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF3P15923 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF3P15923 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF3P15923 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF3P15923 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF3P15923 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF3P15923 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF3P15923 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF3P15923 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF3P15923 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF3P15923 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF3P15923 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF3P15923 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF3P15923 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF3P15923 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF3P15923 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF3P15923 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF3P15923 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF3P15923 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF3P15923 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF3P15923 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF3P15923 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF3P15923 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF3P15923 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF3P15923 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF3P15923 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF3P15923 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF3P15923 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF3P15923 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF3P15923 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF3P15923 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF3P15923 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCF3P15923 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF3P15923 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF3P15923 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF3P15923 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF3P15923 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF3P15923 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF3P15923 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF3P15923 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF3P15923 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF3P15923 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF3P15923 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF3P15923 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF3P15923 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF3P15923 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF3P15923 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF3P15923 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF3P15923 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF3P15923 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF3P15923 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF3P15923 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF3P15923 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF3P15923 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF3P15923 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF3P15923 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCF3P15923 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCF3P15923 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCF3P15923 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCF3P15923 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF3P15923 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF3P15923 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF3P15923 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms