Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB1P11230 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB1P11230 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms