Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C8orf89P0DMQ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C8orf89P0DMQ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf89P0DMQ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms