Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PNMA6AP0CW24 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA6AP0CW24 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA6AP0CW24 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms