Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC159P0C7I6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms