Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB1P08034 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB1P08034 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB1P08034 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB1P08034 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB1P08034 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB1P08034 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB1P08034 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB1P08034 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB1P08034 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB1P08034 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB1P08034 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB1P08034 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB1P08034 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB1P08034 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB1P08034 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB1P08034 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB1P08034 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB1P08034 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB1P08034 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB1P08034 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB1P08034 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB1P08034 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB1P08034 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB1P08034 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB1P08034 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJB1P08034 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJB1P08034 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJB1P08034 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJB1P08034 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GJB1P08034 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJB1P08034 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GJB1P08034 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJB1P08034 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJB1P08034 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJB1P08034 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJB1P08034 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJB1P08034 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJB1P08034 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJB1P08034 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJB1P08034 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB1P08034 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB1P08034 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB1P08034 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB1P08034 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB1P08034 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB1P08034 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB1P08034 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB1P08034 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB1P08034 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB1P08034 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB1P08034 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB1P08034 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB1P08034 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB1P08034 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB1P08034 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB1P08034 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB1P08034 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB1P08034 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB1P08034 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB1P08034 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB1P08034 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB1P08034 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB1P08034 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB1P08034 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GJB1P08034 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GJB1P08034 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB1P08034 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB1P08034 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB1P08034 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB1P08034 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB1P08034 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB1P08034 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB1P08034 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB1P08034 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB1P08034 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB1P08034 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB1P08034 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB1P08034 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB1P08034 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB1P08034 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB1P08034 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB1P08034 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB1P08034 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB1P08034 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB1P08034 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB1P08034 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB1P08034 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB1P08034 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB1P08034 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB1P08034 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB1P08034 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB1P08034 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB1P08034 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB1P08034 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB1P08034 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB1P08034 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GJB1P08034 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB1P08034 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB1P08034 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms