Protein–RNA interactions for Protein: P04553

PRM1, Sperm protamine P1, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM1P04553 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PRM1P04553 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRM1P04553 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRM1P04553 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRM1P04553 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PRM1P04553 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PRM1P04553 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms