Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNAP02545 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNAP02545 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNAP02545 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNAP02545 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNAP02545 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNAP02545 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNAP02545 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNAP02545 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNAP02545 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNAP02545 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNAP02545 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNAP02545 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNAP02545 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNAP02545 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNAP02545 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNAP02545 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNAP02545 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNAP02545 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNAP02545 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNAP02545 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNAP02545 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNAP02545 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNAP02545 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNAP02545 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNAP02545 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNAP02545 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNAP02545 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNAP02545 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNAP02545 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNAP02545 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNAP02545 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNAP02545 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNAP02545 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNAP02545 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNAP02545 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNAP02545 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNAP02545 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNAP02545 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNAP02545 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNAP02545 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNAP02545 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNAP02545 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNAP02545 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMNAP02545 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMNAP02545 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNAP02545 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNAP02545 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNAP02545 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNAP02545 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNAP02545 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNAP02545 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNAP02545 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNAP02545 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNAP02545 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNAP02545 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNAP02545 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNAP02545 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNAP02545 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNAP02545 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNAP02545 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNAP02545 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNAP02545 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNAP02545 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNAP02545 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNAP02545 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNAP02545 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNAP02545 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNAP02545 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNAP02545 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNAP02545 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNAP02545 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNAP02545 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNAP02545 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNAP02545 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNAP02545 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNAP02545 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNAP02545 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNAP02545 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNAP02545 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNAP02545 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNAP02545 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNAP02545 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNAP02545 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNAP02545 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNAP02545 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNAP02545 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNAP02545 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNAP02545 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNAP02545 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNAP02545 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNAP02545 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNAP02545 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNAP02545 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNAP02545 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNAP02545 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNAP02545 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNAP02545 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNAP02545 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMNAP02545 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms