Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX3O95343 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX3O95343 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX3O95343 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX3O95343 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX3O95343 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX3O95343 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX3O95343 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX3O95343 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX3O95343 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX3O95343 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX3O95343 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX3O95343 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX3O95343 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX3O95343 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX3O95343 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX3O95343 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX3O95343 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX3O95343 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX3O95343 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX3O95343 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX3O95343 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX3O95343 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIX3O95343 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIX3O95343 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX3O95343 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX3O95343 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX3O95343 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX3O95343 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX3O95343 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX3O95343 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX3O95343 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX3O95343 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX3O95343 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX3O95343 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX3O95343 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX3O95343 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX3O95343 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX3O95343 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX3O95343 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX3O95343 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX3O95343 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX3O95343 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX3O95343 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX3O95343 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX3O95343 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX3O95343 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX3O95343 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX3O95343 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX3O95343 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX3O95343 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX3O95343 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX3O95343 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX3O95343 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX3O95343 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX3O95343 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX3O95343 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX3O95343 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX3O95343 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX3O95343 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX3O95343 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX3O95343 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX3O95343 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX3O95343 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX3O95343 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX3O95343 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX3O95343 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX3O95343 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX3O95343 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX3O95343 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX3O95343 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX3O95343 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX3O95343 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX3O95343 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX3O95343 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX3O95343 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX3O95343 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX3O95343 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX3O95343 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX3O95343 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX3O95343 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX3O95343 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX3O95343 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX3O95343 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX3O95343 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX3O95343 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX3O95343 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX3O95343 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX3O95343 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX3O95343 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX3O95343 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX3O95343 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX3O95343 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX3O95343 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX3O95343 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX3O95343 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX3O95343 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX3O95343 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX3O95343 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX3O95343 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms