Protein–RNA interactions for Protein: O75934

BCAS2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS2O75934 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BCAS2O75934 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCAS2O75934 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS2O75934 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS2O75934 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS2O75934 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS2O75934 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS2O75934 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS2O75934 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS2O75934 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS2O75934 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS2O75934 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms