Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6AO75865 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms