Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFPL2O75678 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RFPL2O75678 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFPL2O75678 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms