Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP3O75386 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP3O75386 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP3O75386 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP3O75386 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP3O75386 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP3O75386 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP3O75386 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP3O75386 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP3O75386 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP3O75386 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP3O75386 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP3O75386 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TULP3O75386 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TULP3O75386 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TULP3O75386 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TULP3O75386 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP3O75386 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP3O75386 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP3O75386 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP3O75386 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TULP3O75386 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TULP3O75386 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TULP3O75386 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TULP3O75386 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TULP3O75386 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TULP3O75386 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TULP3O75386 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TULP3O75386 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TULP3O75386 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TULP3O75386 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP3O75386 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP3O75386 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP3O75386 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP3O75386 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP3O75386 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP3O75386 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP3O75386 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP3O75386 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP3O75386 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP3O75386 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP3O75386 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP3O75386 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP3O75386 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP3O75386 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP3O75386 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP3O75386 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP3O75386 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP3O75386 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP3O75386 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP3O75386 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP3O75386 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP3O75386 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP3O75386 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP3O75386 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP3O75386 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP3O75386 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP3O75386 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP3O75386 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TULP3O75386 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TULP3O75386 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TULP3O75386 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TULP3O75386 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TULP3O75386 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TULP3O75386 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TULP3O75386 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP3O75386 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP3O75386 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP3O75386 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP3O75386 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP3O75386 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP3O75386 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP3O75386 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP3O75386 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP3O75386 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP3O75386 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP3O75386 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP3O75386 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP3O75386 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP3O75386 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP3O75386 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP3O75386 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP3O75386 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP3O75386 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP3O75386 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP3O75386 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP3O75386 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP3O75386 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP3O75386 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP3O75386 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP3O75386 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP3O75386 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP3O75386 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP3O75386 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP3O75386 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP3O75386 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP3O75386 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP3O75386 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP3O75386 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP3O75386 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.5 ms