Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIN3BO75182 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms