Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BRD4O60885 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BRD4O60885 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BRD4O60885 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BRD4O60885 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BRD4O60885 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BRD4O60885 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
BRD4O60885 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
BRD4O60885 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BRD4O60885 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BRD4O60885 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BRD4O60885 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BRD4O60885 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BRD4O60885 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
BRD4O60885 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BRD4O60885 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BRD4O60885 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BRD4O60885 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BRD4O60885 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BRD4O60885 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BRD4O60885 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BRD4O60885 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BRD4O60885 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
BRD4O60885 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BRD4O60885 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BRD4O60885 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BRD4O60885 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BRD4O60885 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BRD4O60885 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BRD4O60885 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
BRD4O60885 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
BRD4O60885 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BRD4O60885 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BRD4O60885 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BRD4O60885 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BRD4O60885 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BRD4O60885 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BRD4O60885 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BRD4O60885 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BRD4O60885 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BRD4O60885 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BRD4O60885 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BRD4O60885 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BRD4O60885 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BRD4O60885 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BRD4O60885 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BRD4O60885 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BRD4O60885 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BRD4O60885 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BRD4O60885 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BRD4O60885 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BRD4O60885 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BRD4O60885 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BRD4O60885 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BRD4O60885 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BRD4O60885 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BRD4O60885 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BRD4O60885 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BRD4O60885 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BRD4O60885 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BRD4O60885 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BRD4O60885 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BRD4O60885 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
BRD4O60885 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BRD4O60885 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
BRD4O60885 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
BRD4O60885 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
BRD4O60885 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BRD4O60885 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BRD4O60885 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BRD4O60885 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BRD4O60885 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BRD4O60885 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BRD4O60885 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BRD4O60885 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BRD4O60885 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
BRD4O60885 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BRD4O60885 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BRD4O60885 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BRD4O60885 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BRD4O60885 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BRD4O60885 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BRD4O60885 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BRD4O60885 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BRD4O60885 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BRD4O60885 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BRD4O60885 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BRD4O60885 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BRD4O60885 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BRD4O60885 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BRD4O60885 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BRD4O60885 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BRD4O60885 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BRD4O60885 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BRD4O60885 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BRD4O60885 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
BRD4O60885 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
BRD4O60885 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
BRD4O60885 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
BRD4O60885 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms