Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCO2O43819 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCO2O43819 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCO2O43819 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCO2O43819 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCO2O43819 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCO2O43819 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCO2O43819 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCO2O43819 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCO2O43819 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCO2O43819 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCO2O43819 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCO2O43819 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCO2O43819 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCO2O43819 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCO2O43819 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCO2O43819 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCO2O43819 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCO2O43819 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCO2O43819 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCO2O43819 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCO2O43819 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCO2O43819 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCO2O43819 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCO2O43819 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCO2O43819 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCO2O43819 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCO2O43819 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCO2O43819 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCO2O43819 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCO2O43819 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCO2O43819 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCO2O43819 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCO2O43819 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCO2O43819 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCO2O43819 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCO2O43819 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCO2O43819 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCO2O43819 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCO2O43819 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCO2O43819 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCO2O43819 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCO2O43819 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCO2O43819 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCO2O43819 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCO2O43819 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCO2O43819 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCO2O43819 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCO2O43819 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCO2O43819 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCO2O43819 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCO2O43819 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCO2O43819 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCO2O43819 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCO2O43819 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCO2O43819 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCO2O43819 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCO2O43819 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCO2O43819 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCO2O43819 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCO2O43819 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCO2O43819 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCO2O43819 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCO2O43819 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCO2O43819 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCO2O43819 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCO2O43819 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCO2O43819 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCO2O43819 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCO2O43819 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCO2O43819 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCO2O43819 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCO2O43819 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCO2O43819 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCO2O43819 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCO2O43819 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCO2O43819 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCO2O43819 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCO2O43819 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCO2O43819 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCO2O43819 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCO2O43819 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCO2O43819 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCO2O43819 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCO2O43819 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCO2O43819 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCO2O43819 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCO2O43819 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCO2O43819 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCO2O43819 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCO2O43819 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCO2O43819 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCO2O43819 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCO2O43819 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCO2O43819 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCO2O43819 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCO2O43819 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCO2O43819 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCO2O43819 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCO2O43819 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms