Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAFD1O14545 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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