Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD12O00232 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms