Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms