Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC160A6NGH7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms