Protein–RNA interactions for Protein: A6NEV1

PRR23A, Proline-rich protein 23A, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23AA6NEV1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRR23AA6NEV1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRR23AA6NEV1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRR23AA6NEV1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRR23AA6NEV1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms