Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCCD1A6NED2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms