Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ27

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ27 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A1W2PQ27 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1W2PQ27 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1W2PQ27 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1W2PQ27 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1W2PQ27 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1W2PQ27 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1W2PQ27 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1W2PQ27 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1W2PQ27 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1W2PQ27 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1W2PQ27 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1W2PQ27 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
A0A1W2PQ27 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1W2PQ27 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1W2PQ27 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms