Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
U3KQE9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
U3KQE9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
U3KQE9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
U3KQE9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
U3KQE9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
U3KQE9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
U3KQE9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
U3KQE9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
U3KQE9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U3KQE9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U3KQE9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U3KQE9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U3KQE9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
U3KQE9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U3KQE9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U3KQE9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
U3KQE9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U3KQE9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U3KQE9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U3KQE9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U3KQE9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U3KQE9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
U3KQE9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U3KQE9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
U3KQE9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
U3KQE9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
U3KQE9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U3KQE9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U3KQE9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U3KQE9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U3KQE9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U3KQE9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U3KQE9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U3KQE9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U3KQE9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U3KQE9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U3KQE9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U3KQE9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U3KQE9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U3KQE9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U3KQE9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U3KQE9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
U3KQE9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U3KQE9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U3KQE9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U3KQE9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U3KQE9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U3KQE9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U3KQE9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U3KQE9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U3KQE9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
U3KQE9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U3KQE9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
U3KQE9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
U3KQE9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
U3KQE9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
U3KQE9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
U3KQE9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
U3KQE9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U3KQE9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U3KQE9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
U3KQE9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U3KQE9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
U3KQE9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U3KQE9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U3KQE9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U3KQE9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U3KQE9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
U3KQE9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U3KQE9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U3KQE9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U3KQE9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
U3KQE9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U3KQE9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
U3KQE9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U3KQE9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
U3KQE9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U3KQE9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
U3KQE9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U3KQE9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KQE9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KQE9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KQE9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KQE9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KQE9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KQE9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KQE9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KQE9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KQE9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KQE9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KQE9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KQE9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KQE9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KQE9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KQE9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KQE9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KQE9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KQE9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KQE9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms