Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
COPG1Q9Y678 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPG1Q9Y678 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms