Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y657

SPIN1, Spindlin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN1Q9Y657 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN1Q9Y657 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN1Q9Y657 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN1Q9Y657 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN1Q9Y657 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN1Q9Y657 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN1Q9Y657 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN1Q9Y657 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN1Q9Y657 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN1Q9Y657 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms