Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF12Q9Y4X4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF12Q9Y4X4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms