Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIT1Q9Y3P8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIT1Q9Y3P8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIT1Q9Y3P8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.7 ms