Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COQ4Q9Y3A0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COQ4Q9Y3A0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms