Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPR55Q9Y2T6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPR55Q9Y2T6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms