Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC56.92■■■■■ 6.7
NISCHQ9Y2I1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC56.92■■■■■ 6.7
NISCHQ9Y2I1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC56.92■■■■■ 6.7
NISCHQ9Y2I1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC56.91■■■■■ 6.7
NISCHQ9Y2I1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC56.91■■■■■ 6.7
NISCHQ9Y2I1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC56.9■■■■■ 6.7
NISCHQ9Y2I1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC56.9■■■■■ 6.7
NISCHQ9Y2I1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC56.9■■■■■ 6.7
NISCHQ9Y2I1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.89■■■■■ 6.7
NISCHQ9Y2I1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC56.89■■■■■ 6.7
NISCHQ9Y2I1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.89■■■■■ 6.7
NISCHQ9Y2I1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC56.88■■■■■ 6.7
NISCHQ9Y2I1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC56.88■■■■■ 6.7
NISCHQ9Y2I1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC56.87■■■■■ 6.69
NISCHQ9Y2I1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.87■■■■■ 6.69
NISCHQ9Y2I1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC56.86■■■■■ 6.69
NISCHQ9Y2I1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC56.86■■■■■ 6.69
NISCHQ9Y2I1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.86■■■■■ 6.69
NISCHQ9Y2I1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC56.86■■■■■ 6.69
NISCHQ9Y2I1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC56.85■■■■■ 6.69
NISCHQ9Y2I1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC56.84■■■■■ 6.69
NISCHQ9Y2I1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC56.84■■■■■ 6.69
NISCHQ9Y2I1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.84■■■■■ 6.69
NISCHQ9Y2I1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC56.84■■■■■ 6.69
NISCHQ9Y2I1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC56.84■■■■■ 6.69
NISCHQ9Y2I1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC56.82■■■■■ 6.69
NISCHQ9Y2I1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC56.81■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC56.81■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC56.81■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.8■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC56.8■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC56.79■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC56.79■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.79■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC56.79■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC56.79■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC56.79■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC56.79■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC56.77■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC56.76■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.76■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.75■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC56.75■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.75■■■■■ 6.68
NISCHQ9Y2I1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC56.74■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.73■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC56.73■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC56.73■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.73■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC56.72■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.72■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.72■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC56.71■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.71■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.7■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.7■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC56.7■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.7■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.69■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.69■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC56.69■■■■■ 6.67
NISCHQ9Y2I1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC56.69■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC56.68■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC56.67■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC56.67■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC56.67■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC56.67■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.66■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC56.66■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC56.66■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.66■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC56.65■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC56.65■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC56.65■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.65■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.64■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.64■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC56.64■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC56.63■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC56.63■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC56.62■■■■■ 6.66
NISCHQ9Y2I1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.62■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC56.61■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC56.61■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC56.61■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC56.61■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC56.61■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.61■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.6■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.6■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC56.59■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC56.59■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC56.59■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.59■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC56.58■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.58■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC56.58■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC56.58■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC56.58■■■■■ 6.65
NISCHQ9Y2I1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.57■■■■■ 6.65
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