Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC3AQ9Y2H6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC3AQ9Y2H6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms