Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRQQ9UMZ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms