Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL8

SHROOM4, Protein Shroom4, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM4Q9ULL8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC46.31■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC46.31■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.3■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC46.3■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC46.29■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC46.28■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 5
SHROOM4Q9ULL8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC46.23■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.22■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.22■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
SHROOM4Q9ULL8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC46.19■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC46.16■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.15■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC46.13■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
SHROOM4Q9ULL8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC46.12■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC46.07■■■■■ 4.97
SHROOM4Q9ULL8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC46.06■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC46.06■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.05■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC46.04■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.02■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC46.01■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC46.01■■■■■ 4.96
SHROOM4Q9ULL8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
SHROOM4Q9ULL8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
SHROOM4Q9ULL8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
SHROOM4Q9ULL8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC46■■■■■ 4.95
SHROOM4Q9ULL8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
SHROOM4Q9ULL8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
SHROOM4Q9ULL8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC45.99■■■■■ 4.95
SHROOM4Q9ULL8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
SHROOM4Q9ULL8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.98■■■■■ 4.95
SHROOM4Q9ULL8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
SHROOM4Q9ULL8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC45.98■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms