Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
INO80Q9ULG1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
INO80Q9ULG1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
INO80Q9ULG1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
INO80Q9ULG1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
INO80Q9ULG1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
INO80Q9ULG1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
INO80Q9ULG1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
INO80Q9ULG1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
INO80Q9ULG1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
INO80Q9ULG1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms