Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL6Q9UKU0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL6Q9UKU0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL6Q9UKU0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL6Q9UKU0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL6Q9UKU0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL6Q9UKU0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACSL6Q9UKU0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL6Q9UKU0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL6Q9UKU0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms