Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RCOR1Q9UKL0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCOR1Q9UKL0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms