Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJP4

KLHL21, Kelch-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL21Q9UJP4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL21Q9UJP4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL21Q9UJP4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms