Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRDQ9UH36 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SRRDQ9UH36 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRRDQ9UH36 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms