Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA6Q9UF33 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA6Q9UF33 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms