Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APEX2Q9UBZ4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms