Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSFQ9UBX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms