Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE7Q9UBL6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE7Q9UBL6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms