Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATXN10Q9UBB4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN10Q9UBB4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 600.9 ms